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DNA甲基化【5mC】修饰即【亚硫酸氢盐转化】试剂盒选型指南

DNA甲基化【5mC】修饰即【亚硫酸氢盐转化】试剂盒选型指南

  • 作者:IVDSHOW
  • 来源:IVDSHOW
  • 发布时间:2022-11-02 11:45
  • 访问量:

【概要描述】亚硫酸氢盐转化是一种技术,其中使用亚硫酸氢钠将胞嘧啶转化为尿嘧啶,而5-甲基胞嘧啶(5-mC)保持不变。更多视频请关注视频号【艾维缔】。哔哩哔哩【IVDSHOW】。抖音【军哥聊表观】。

DNA甲基化【5mC】修饰即【亚硫酸氢盐转化】试剂盒选型指南

【概要描述】亚硫酸氢盐转化是一种技术,其中使用亚硫酸氢钠将胞嘧啶转化为尿嘧啶,而5-甲基胞嘧啶(5-mC)保持不变。更多视频请关注视频号【艾维缔】。哔哩哔哩【IVDSHOW】。抖音【军哥聊表观】。

  • 分类:产品解读
  • 作者:IVDSHOW
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  • 发布时间:2022-11-02 11:45
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      亚硫酸氢盐转化是一种技术,其中使用亚硫酸氢钠将胞嘧啶转化为尿嘧啶,而5-甲基胞嘧啶(5-mC)保持不变。基于亚硫酸盐和亚硫酸钠的方法是研究DNA甲基化的常用方法,有助于准备基因组DNA进行基因特异性DNA甲基化分析。亚硫酸盐转化后通常会有下游的应用,如PCR或测序。未甲基化的胞嘧啶残基被脱氨为尿嘧啶,而甲基化的胞嘧啶(5-mC)残基不受影响,使PCR扩增能够识别尿嘧啶为胸腺嘧啶,5-mC或5-hmC为胞嘧啶。这使研究人员能够区分甲基化和非甲基化的胞嘧啶残基,提供有关DNA甲基化区域的单核苷酸分辨率信息。完整的转换对于成功的DNA甲基化研究是必要的,同时也减少了由于通常苛刻的化学反应而发生的DNA降解量。

       在亚硫酸氢盐处理后在基因特异性基础上分析DNA甲基化的流行下游方法包括亚硫酸氢盐测序、甲基化特异性PCR(MS-PCR)、实时荧光甲基化特异性定量(qMSP,MS-qPCR)和基于甲基化的微阵列。考虑到你的下游应用可以帮助确定哪种亚硫酸氢盐转化方法是理想的,特别是由于转化后片段大小的变化。DNA甲基化极速修饰试剂盒是专门针对实时MSP和qMSP的,而最畅销的DNA修饰试剂盒是为了与Illumina工作流程和下一代测序(NGS)兼容。如果在测序前需要更快、更容易的亚硫酸氢盐转化,DNA甲基化极速修饰试剂盒转化简易试剂盒可以在短短60分钟内完成,它使用的是液体亚硫酸氢盐。

       从高质量的DNA开始是很关键的,特别是因为转换过程中的酸性会使DNA产生片段。对于含有少量DNA的样品,推荐使用DNA甲基化直接修饰试剂盒,因为它可以直接从细胞、组织、血液和其他起始材料中转换。在处理大规模的亚硫酸氢盐转化实验时,为了节省时间和降低成本,高通量选择至关重要。在这种情况下,DNA亚硫酸氢盐转化96DNA修饰试剂盒是专门为高通量而精简的,并采用了基于磁珠的96孔格式。关于亚硫酸氢盐转化试剂盒的详细比较,见下表。

产品型号

A-P-1001

DNA甲基化修饰试剂盒

A-P-1008

96孔DNA甲基化修饰试剂盒

A-P-1010

一步法DNA甲基化修饰试剂盒

A-P-1011

通用人DNA甲基化阳性对照

A-P-1016

DNA甲基化直接修饰试剂盒

A-P-1026

DNA甲基化极速修饰试剂盒

主要功能 为DNA添加甲基 为DNA添加甲基 为DNA添加甲基 制备DNA阳性对照 为DNA添加甲基 为DNA添加甲基
起始材料 DNA DNA DNA DNA 100个细胞、组织、1ul血 DNA
输入范围 0.1ng~1 ug 1ng~1 ug 0.1ng~1 ug 50~300 ng

细胞:100~20000;组织:1~100ug

0.2ng~1ug
最佳输入量 50~200 ng 100~200 ng 50~200 ng 200 ng 细胞:500~5000;组织:5~20ug 50~200 ng
检测下限 50 pg、20个细胞 1 ng 50 pg、20个细胞 0.02% ng的 5-mC 500 ng 0.2 ng、50个细胞
总的操作时间 < 2 hours < 2.5 hours < 2 hours < 2.4 hours < 3 hours < 0.5 hours
洗脱体积 8-18ul 40ul/孔 8-18ul 8-20ul 8-18ul 10-20ul
规格 40次、80次 96次、192次 40次、80次 10次、20次 40次、80次 50次、200次
设计要点 离心柱 PCR板 离心柱 离心柱 离心柱 离心柱
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