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2025-04
本文围绕计算表观遗传学展开。先介绍其概念及因高通量技术产生大量数据而兴起的背景;接着阐述DNA甲基化和组蛋白修饰的测量方法、数据资源;再详细说明亚硫酸氢盐测序等多种数据分析方法及工具;然后提及表观遗传状态预测和整合表观基因组学的内容;最后指出该领域的转变及面临的挑战和机遇。
2025-04-15
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2025-04
本文围绕非编码RNA的RNA测序技术展开。介绍其研究背景,转录组重建与检测算法;cDNA文库构建中rRNA去除及链特异性文库制备方法;低丰度RNA检测手段;转录和降解速率估算方式。指出技术有进展也有局限,核糖体图谱技术对定义有挑战,RNA-seq可用于功能研究,单细胞RNA-seq意义重大。
2025-04-15
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2025-04
本文围绕哺乳动物全基因组组蛋白修饰展开。介绍ChIP-seq等研究技术及新方案,阐述甲基化、乙酰化等修饰类型和功能,分析启动子等关键区域修饰特征,指出修饰改变与疾病相关,最后提出当前研究面临挑战,未来需多学科协作推动发展。
2025-04-15
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2025-04
本文综述全基因组评估DNA胞嘧啶修饰方法。早期有基于限制性内切酶法,如DMH等;亚硫酸氢盐测序可单碱基分辨甲基化,发展出WGBS、RRBS等;还有Infinium芯片、MALDI - TOF MS等方法;亲和纯化类有MeDIP、MBD - seq等;5-羟甲基胞嘧啶定位有TAB - seq、OxBS - Seq ,未来技术有新方向。
2025-04-15
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本文围绕基因特异性DNA甲基化分析展开,介绍了基于甲基化敏感限制酶、亚硫酸氢盐转化等分析原理;阐述了亚硫酸氢盐测序、甲基化特异性PCR等多种技术的特点;还给出亚硫酸氢盐介导转化、各常用方法的操作小贴士,强调选合适技术和最佳条件获可靠数据。
2025-04-15
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