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酶法染色质免疫沉淀试剂盒
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酶法染色质免疫沉淀试剂盒

酶法染色质免疫沉淀试剂盒,ChIP-IT® Express Enzymatic,非常适合开展在甲醛固定细胞中分析全基因组范围的开放染色质区域。更多视频请关注视频号【艾维缔】。哔哩哔哩【IVDSHOW】。抖音【军哥聊表观】。
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染色质免疫沉淀(ChIP)在技术上具有挑战性,并且结果难以解读。我们的酶法染色质免疫沉淀试剂盒通过应用蛋白质G偶联磁珠的简化方案来消除其中的一些挑战,使ChIP只需一天就能完成。试剂盒提供超声或者酶消化两种方案制备染色质。使用我们提供的染色质对照试剂盒和qPCR引物组引物组和已剪切好的染色质来完成您的实验设计,可以在每一步验证您的结果。要了解这些功能与我们提供的其他ChIP试剂盒的差异,请参阅我们的ChIP试剂盒选择指南。

ChIP涉及免疫沉淀经过交联固定的蛋白/DNA复合物。首先,完整的细胞用甲醛固定交联,从而保持蛋白和DNA的相互作用。然后,DNA被剪切成均匀的小片段,使用目标DNA结合蛋白的抗体免疫沉淀DNA/蛋白复合物。免疫沉淀后,DNA经过洗涤,解交联,蛋白被蛋白酶K处理去除。洗脱后的DNA可以用我们的染色体免疫沉淀DNA纯化试剂盒进行纯化,纯化后的DNA可以直接进行qPCR或NGS测序下游分析。

图1:使用酶法染色质免疫沉淀试剂盒示意图可提供高质量的ChIP-Seq数据

使用3µg 我们的AbFlex®组蛋白H3K9ac重组抗体(目录号91103)和的酶法染色质免疫沉淀试剂盒25µg来自K-562细胞的染色质。在ChIP之后,使用下一代DNA文库建库试剂盒(目录号53216和53264)制备Illumina兼容测序文库,并使用NextSeq 500进行测序。结果显示高质量的ChIP-Seq信号峰横跨1号染色体的一个区域。

图2:使用酶法染色质免疫沉淀试剂盒免疫沉淀组蛋白修饰H3K9ac的ChIP-Seq数据  使用酶法染色质免疫沉淀试剂盒富集组蛋白修饰H3K9ac的ChIP qPCR数据

使用3µg 我们的AbFlex®组蛋白修饰H3K9ac重组抗体(货号91103)和酶法染色质免疫沉淀试剂盒免疫沉淀25µg K-562细胞染色质。ChIP后,DNA按1:20稀释,使用我们的人阳性对照引物组ACTB-1和GAPDH-1(货号号71003和71004),人阴性对照引物组1(货号71001)进行qPCR。结果以每1000个细胞检测到的结合情况展示,结果显示阳性对照PCR引物有富集,而阴性对照引物几乎没有富集。

图3:使用酶法染色质免疫沉淀试剂盒免疫沉淀组蛋白修饰H3K9ac的ChIP-qPCR数据

酶法染色质免疫沉淀试剂盒具有如下优势和特性:

  • ChIP-IT Express超声法对于难以裂解的细胞、培养细胞和组织样品来说是高质量的染色质片段化方案。
  • 如无超声仪,培养细胞系样本只需简单的使用我们的ChIP-IT Express Enzymatic kit。
  • 快速的操作步骤使ChIP实验在一天内完成成为可能。
  • 蛋白质G磁珠提供低背景富集和简化的洗涤步骤。

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酶法染色质免疫沉淀试剂盒 53009 25次 -20°C

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FAQ

“Polymorphism rs7278468 is associated with Age-related cataract through decreasing transcriptional activity of the CRYAA promoter.” by Ma et al. (2016) Scientific Reports 6(23206).

“Deep sequencing and in silico analyses identify MYB-regulated gene networks and signaling pathways in pancreatic cancer.” by Azim et al. (2016) Sci. Rep. 6(28446).

“Overexpression of IFN-induced protein with tetratricopeptide repeats 3 (IFIT3) in pancreatic cancer: cellular "pseudoinflammation" contributing to an aggressive phenotype.” by Niess et al. (2015) Oncotarget 6(5): 3306-3318.

“Peretinoin, an Acyclic Retinoid, Inhibits Hepatitis B Virus Replication by Suppressing Sphingosine Metabolic Pathway In Vitro.” by Murai et al. (2018) Int J Mol Sci. 19(2): E108.

“LIMD1 is induced by and required for LMP1 signaling, and protects EBV-transformed cells from DNA damage-induced cell death.” by Wang et al. (2018) Oncotarget 9(5): 6282–6297.

“Human Beta Defensin 2 Selectively Inhibits HIV-1 in Highly Permissive CCR6⁺CD4⁺ T Cells.” by Lafferty et al. (2017) Viruses 9(5): E111.

“CCCTC-binding factor recruitment to the early region of the human papillomavirus 18 genome regulates viral oncogene expression.” by Paris et al. (2015) J Virol. 89(9):4770-85.

“Expansion of a novel endogenous retrovirus throughout the pericentromeres of modern humans.” by Zahn et al. (2015) Genome Biol 16:74.

“HIV-1 induced nuclear factor I-B (NF-IB) expression negatively regulates HIV-1 replication through interaction with the long terminal repeat region.” by Vemula et al. (2015) Viruses 7(2):543-58.

“Inflammation-induced miRNA-155 inhibits self-renewal of neural stem cells via suppression of CCAAT/enhancer binding protein β (C/EBPβ) expression.” by Obora et al. (2017) Sci Rep 7:43604.

“BH3 mimetics suppress CXCL12 expression in human malignant peripheral nerve sheath tumor cells.” by Graham et al. (2017) Oncotarget 8(5): 8670–8678.

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