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配对标签技术将抗体靶向染色质图谱分析与单细胞RNA测序相结合，无需再单独开展单细胞切割与标签测序（scCUT&Tag）和单细胞RNA测序（scRNA-seq）实验。通过同时捕获转录组和表观遗传信息，研究人员能够直接探究基因调控如何与不同细胞类型及条件下的染色质状态相关联。
研究人员将配对标签技术应用于发育生物学、癌症基因组学、免疫学和扰动研究领域，以绘制染色质修饰与基因表达在细胞转化、疾病进展及治疗反应过程中的相互作用图谱。
单细胞染色质RNA联合测序试剂盒具有如下优势和特性：
- 全面表观遗传图谱分析:可靶向任何经过验证的抗体——组蛋白修饰、转录因子或染色质重塑因子——同时保留RNA完整性。将H3K4me3、H3K27me3、H3K27ac等修饰标记与基因表达谱结合，以绘制调控图谱。该技术远超ATAC-seq对开放染色质的观察视角，能够揭示驱动细胞身份的特异性蛋白质-DNA相互作用。
- 无缝 10x 整合:专为兼容 10x Genomics Chromium 工作流程（ATAC 或 Multiome 试剂盒）而设计。使用 Paired-Tag 试剂制备的细胞核可直接进入标准的 10x 条形码标记流程，无需定制硬件或修改工作流程。分析流程（Seurat、Signac、ArchR）采用成熟的多组学方法处理 Paired-Tag 数据。
- 无需分选的细胞特异性分析:基于RNA的注释可事后识别稀有细胞群、发育阶段和疾病状态——无需流式细胞术。可在缺乏表面标志物或过于脆弱无法分选的细胞类型中发现表观遗传特征。适用于细胞组成异质的组织，这类组织若预先富集会引入偏差或技术伪影。
单细胞染色质RNA联合测序试剂盒主要应用领域：
- 发育生物学：追踪细胞谱系定型过程中组蛋白修饰与转录因子结合的动态变化。通过将染色质可及性变化与发育时间序列中的基因表达波动相关联，绘制细胞命运决定图谱。
- 癌症与疾病：通过将异常染色质状态与单细胞中癌基因表达关联起来，分析肿瘤异质性。鉴定治疗耐药性的表观遗传驱动因素，并发现具有干细胞样染色质特征的稀有细胞群。
- 免疫学与细胞命运：通过调控标记和细胞因子表达的协同变化来表征免疫细胞激活状态。解析染色质重塑如何调控T细胞耗竭、巨噬细胞极化以及先天免疫记忆。
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产品组分
内容
型号
规格 储存温度
单细胞染色质RNA联合测序试剂盒
DP16-01 8次
-20°C 单细胞染色质RNA联合测序试剂盒
DP16-02 16次
-20°C 操作手册
1 1 常温
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营销中心
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注意事项
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FAQ
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Espeso-Gil, S., et al. (2020). A chromatin connectome for psychiatric and metabolic risk variants in adult dopaminergic neurons. Genome Medicine, 12, 114. https://doi.org/10.1186/s13073-020-00799-2
Dixon, Jesse R., et al. (2018). Integrative detection and analysis of structural variation in cancer genomes using high-throughput sequencing and Hi-C (hic_breakfinder). Nature Genetics, 2018.
Wingett, Steven, et al. (2015). HiCUP: Pipeline for mapping and processing Hi-C data. F1000Research, 4, 1310.
Durand, Neva C., et al. (2016). Juicer provides a one-click system for analyzing loop-resolution Hi-C experiments. Cell Systems, 3(1), 95–98.
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