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RNA甲基化极易测序试剂盒(illumina)
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RNA甲基化极易测序试剂盒(illumina)

RNA甲基化极易测序试剂盒(illumina)非常适合从各种样本中提取的RNA,进行亚硫酸盐处理后,基于illumina平台的RNA甲基化测序分析和各种NGS分析。主要测序分析平台:illumina仪器。更多视频请关注视频号【艾维缔】。哔哩哔哩【IVDSHOW】。抖音【军哥聊表观】。
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在 DNA 中 5-甲基胞嘧啶通过 DNA 甲基转移酶甲基组的同价原理发生在胞嘧啶环的第五位碳原子上。这个过程很好地被研究并且通常伴随有基因的表达和抑制。尤其是在人类中观测到,5-甲基胞嘧啶发生在各种形式的 RNA 分子中,包括 tRNAs,rRNAs,mRNAs 和非编码RNAs(ncRNAs)。5-甲基胞嘧啶看起来都富集于 ncRNA 这类中,但是相对的在 mRNAs 中是在减少。 5-甲基胞嘧啶的水平在动物基因组中是不一样的,水平量在一些昆虫中不被发觉的到在人类细胞中大概有 0.1-0.45%的总 RNA 量。大多数(83%)的 5-甲基胞嘧啶是在 mRNAs 中发现的。在这些转录中,5-甲基胞嘧啶在蛋白编码测序中出现减少;而在 5’和 3’UTRs 中出现富集。众所周知,2 种不同的甲基转移酶,NSUN2 和 DNMT2 在真核生物 RNA 中通过催化5-甲基胞嘧啶的修饰形式,会减少 5-mC。现在已经有很有力的证据表明:RNA 胞嘧啶的甲基化影响着各种生物进化的规则例如:RNA 稳定性和 mRNA 翻译。此外,在拱形 RNAs 中 5-mC的缺失会异常的引起相关的小 RNA 片段化且这些小 RNA 发挥着正常的功能。因此,拱形 ncRNA的损失可能有助于发现人类因缺失 NSUN2 而引起的发挥失调。

最近,一些新颖的核苷酸修饰形式,首先在DNA中发现。比如:5-hmC,5-fC,5-caC。同时这些形式在人类和小鼠的组织中也被检测到。这些修饰的核苷酸一般是由5-mC氧化后得到的;通过TET家族酶反应得到。在大规模转录组中RNA胞嘧啶甲基化状态有关的可信信息通过二代测序得到了很多有关RNA亚硫酸盐转化的信息。在二代测序中更好且高效的使用亚硫酸盐转化RNA文库制备。我们合作开发了第一款RNA亚硫酸盐测序试剂盒(illumina)(A-P-9006)通过亚硫酸盐处理之后技术和更为深入的研究RNA甲基化分析知识,我们特别的优化了试剂配方,开发出了RNA甲基化极易测序试剂盒(illumina)。

对于细胞与组织等样本,RNA甲基化极易测序试剂盒(illumina)具有以下优势和特性:
高敏感性和高效率:通过使用创新的方法让亚硫酸盐转化后的 RNA 成为完整且有标签的标志物成为可能。通过使用未标记的或半标记的 RNA 片段,非条码(singleplexed)和条码(multiplexed)文库制备可以高敏感且高效率,因此,提供了一种可行且稳定的工具来构建 5-mC RNA-测序文库。理想的 RNA 亚硫酸盐处理方法和加强型的可标记减少了片段化的损失和选择性偏差,这可以加强 RNA 输入量的降低至 5ng 且高效率完整的制备可标记的 cDNA 文库。

容易且优化的步骤:整个实验步骤需要在 6 个小时内完成。免凝胶的片段筛选和纯化节约了时间;减少了错误和有价值样本的损失。
完全转化:独创的试剂设计会以大于 99.9%的水平可将未甲基化的胞嘧啶转化为尿嘧啶,没有或微不足道的不恰当的甲基化胞嘧啶转化为胸腺嘧啶(<0.1%)。可以表明使用的样本 RNA 的范围。
极其方便:这个试剂盒包括 RNA 文库制备过程每步所需试剂,对于亚硫酸盐转化,结扎,纯化,片段选择和文库扩增,因此,对于大多数亚硫酸盐处理 RNA 文库制备进行流水化作业是可信且始终如一的结果。
极小的偏差:超级高保真扩增可以用极小量的序列偏差和低错误比率增强了亚硫酸盐转化 RNA 文库 的得率。
宽样本适用性:起始材料可以是从各种组织/细胞样本比如:新鲜和冷冻的组织,培养细胞(来自培养瓶或微孔板)中提取的总体 RNA
操作简便、可信、分析条件始终如一。

产品组分

组分内容

型号:A-P-9007-12(12)

型号:A-P-9007-24(24)

储存温度

CB

Conversion Buffer

3 ml

6 ml

室温
CP Conversion Powder 2瓶 4瓶 室温

NBS

NA Binding Solution

6 ml 12 ml 室温
FSC F-Spin Colume** 15个 30个 室温
FCT F-Collection Tube 15个 30个 室温
DS Desulphonation Solution 100 ul 200 ul 室温

RB

5X Reaction Buffer *

100 ul

200 ul

-20°C

REM

Reaction Enzyme Mix *

50 ul

100 ul

-20°C

AA

Adaptor-A(10uM)*

28 ul 56 ul -20°C

AB

Adaptor-B(10uM)*

28 ul 56 ul -20°C
RDB RNA Digestion Buffer 30 ul 60 ul -20°C
RDB RNA Digestion Enzym* 15 ul 30 ul -20°C
MBB MQ Binding Beads* 1.8 ml 3.6 ml 4°C

HPMM

2X HiFi PCR Master Mix*

12 ul 24 ul -20°C

PU

Primer U(10uM)

15 ul 30 ul -20°C

PI

Primer I(10uM) 15 ul 30 ul -20°C

EB

Elution Buffer

1000 ul 2000 ul -20°C

操作手册

 

1

1

室温

*注意:在使用各溶液之前,将溶液离心至管底。**在将离心柱放置在离心机之前,始终保证盖子盖紧。

文件资源

文件下载 文件内容 资源说明
A-P-9007-RNA甲基化极易测序试剂盒(illumina) 操作手册
A-P-9007-RNA甲基化极易测序试剂盒(illumina)相关说明 宣传单页

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保存建议 推荐蓝冰或冰袋运输。当您收到产品后,按照说明书建议保存各组分。
警告 本品仅供科研使用,请勿用于临床与诊断。

 

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