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SELECT (single-base elongation-and ligation-based qPCR amplification method)[1]检测技术,即单碱基延长和连接的qPCR扩增技术,研发团队为国内一流大学,只需三小时就能完成低丰度转录本中单碱基分辨率的m6A检测,无需抗体富集就能够针对性地对特定位点进行m6A修饰定量,样本间修饰丰度差异分析以及鉴定目标位点是否存在m6A修饰。我们与合作伙伴,致力于在全球范围内实施SELECT-m6A修饰定量检测技术成果转化的授权,为客户提供多款基于SELECT技术检测的试剂盒,填补市场上特定位点m6A常规检测技术的空白,协助研究者鉴定m6A相关蛋白的作用靶点,深入挖掘m6A修饰的作用机制,有望为RNA m6A修饰分子标志物的发现带来新突破。

m6A修饰丰度差异检测试剂盒原理图
m6A修饰丰度差异检测试剂盒基于SELECT技术,通过qPCR方法对A碱基进行修饰位点检测,并通过FTO去甲基化处理进一步鉴定的试剂盒。
参数 MeRIP-qPCR SELECT 精确度 需要 不需要 能否单碱基定量 不可以 可以 总RNA样本所需量 >20μg >1μg 实验时长 >1天 >3小时 实验费用 昂贵 便宜 操作难度 难 简单 应用 1.验证样本间特定位点m6A修饰丰度差异;2.鉴定m6A修饰相关蛋白的作用靶点 1.验证样本间特定位点m6A修饰丰度差异;2.检测RNA目标位点是否存在m6A修饰;3.对特定位点的m6A修饰丰度进行绝对定量;4.鉴定m6A修饰相关蛋白的作用靶点 m6A修饰丰度差异检测试剂盒工作原理:基于单碱基延伸和连接后产物qPCR检测的方法。利用FTO去甲基酶,把RNA模板的mA修饰位点去掉,然后将设计在A位点两端的探针退火后,用高效的SELECT DNA聚合酶的延伸单碱基、SELECT连接酶的缺口连接,由于RNA模板中mA修饰抑制SELECT DNA聚合酶介导的单基延伸,少量延伸产物仍将从RNA模板中给定的A修饰位点形成。在后续的SELECT连接酶的缺口连接中,mA修饰抑制SELECT连接酶的连接活性,经过退火延伸连接后进行qPCR检测。

对比FTO处理后ct值的差异,无m6A修饰位点的RNA模板形成的产物基本一致,即有无FTO处理的样本ct值基本一致,而有A修饰位点的RNA模板形成的产物变化较大,经FTO处理后Ct值明显变小,从而实现简单的基于qPCR的方法进行对m6A位点修饰检测及鉴定。
图1.qPCR扩增曲线和CT值柱形图显示,HeLa细胞IncRNA MALAT1(e)以及HEK293T细胞mRNA H1F0(f)的m6A位点和非m6A位点[1]
图2.利用系列浓度梯度的已知m6A成分标准品制作标准曲线,然后对特定位点上的m6A修饰成分进行定量[1]
图3.SELECT:分析IncRNA MALAT1和以及METTL3+/-细胞(对照组)的m6A2515和A2511(input对照)位点,荧光扩增曲线和PCR CT值柱状图显示IncRNA MALAT.1的2515位点是METTL3的一个靶点[1]m6A修饰丰度差异检测试剂盒具有如下优势和特性:
- 荧光定量PCR进行精确定量,达到单碱基分辨率
- 无需抗体IP,无需同位素标记,降低成本,可操作性高
- 灵敏度高,总RNA所需样本低至1μg
m6A修饰丰度差异检测试剂盒应用领域:
- 验证样本间特定位点m6A修饰丰度差异
- 检测RNA目标位点是否存在m6A修饰
- 对特定位点的m6A修饰丰度进行绝对定量
- 鉴定m6A修饰相关蛋白的作用靶点
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产品组分
组分内容 型号:R2023-01(100次) 型号:R2023-02(200次) 储存温度
SELECT DNA polymerase
30 μL 60 μL -20℃ SELECT ligase 50 μL 100 μL -20℃ Up Probe (0.5μM)* / / -20℃ Down Probe (0.5μM)* / / -20℃ Gene specific primers (F)* / / -20℃ Gene specific primers (R)* / / -20℃ 10X Reaction buffer 200 μL 400 μL -20℃ dNTP 200 μL 400 μL -20℃ ATP 250 μL 500 μL -20℃ Select F (10μM) 100 μL 200 μL -20℃ Select R (10μM) 100 μL 200 μL -20℃ 操作手册 1 1 室温
*注意:在将离心柱放入微型离心机之前,始终将离心柱盖子旋紧盖严。Up Probe,Down Probe需根据MeRIP-Seq分析得到peak区域,检测符合m6A motif修饰特征后,设计探针。Gene specific primer(F/R)设计,设计基因特异性引物并进行qPCR定量,以控制对照与实验组初始RNA量是一致的。
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注意事项
保存建议 推荐蓝冰或冰袋运输。当您收到产品后,按照说明书建议保存各组分。 警告 本品仅供科研使用,请勿用于临床与诊断。 -
FAQ
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[4]Chen,H.,Zhao,X.,Yang,W.et al.RNA N6-methyladenosine modification-based biomarkers for absorbed ionizing radiation dose estimation.Nat Commun14,6912(2023).(SELECT客户文章)
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[11]Cai B,Ma M,Yuan R,et al.MYH1G-AS is a chromatin-associated IncRNA that regulates skeletal muscle development in chicken.Cell MolBiol Lett.2024Jan4;29(1):9.(SELECT客户文章)
[12]Li L,Cheng H,Zhou Y,et al.METTL3 regulates autophagy of hypoxia-induced cardiomyocytes by targeting ATG7.Cell Death Discov.2025;11(1):37.Published2025Feb1.doi:10.1038/s41420-025-02320-3(SELECT客户文章)
[13]Liu K,Wang X,Wang J,et al.N 6-methyladenosine modifications stabilize phosphate starvation response-related mRNAs in plantadaptation to nutrient-deficient stress.Nat Commun.2025;16(1):4093.Published 2025 May 1.doi:10.1038/s41467-025-59331-y (SELECT章)
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