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m6A修饰丰度差异检测试剂盒

m6A修饰丰度差异检测试剂盒,m6A site identification kit,使用优化后的SELECT策略,无需昂贵的抗体,通过qPCR可高效比较基因特定位点(A碱基)发生m6A修饰水平丰度差异。更多视频请关注视频号【艾维缔】。哔哩哔哩【IVDSHOW】。抖音【军哥聊表观】。


关键词

m6A修饰丰度差异检测试剂盒


所属分类


目录号

R2023

  • 产品描述
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  • FAQ
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  • SELECT (single-base elongation-and ligation-based qPCR amplification method)[1]检测技术,即单碱基延长和连接的qPCR扩增技术,研发团队为国内一流大学,只需三小时就能完成低丰度转录本中单碱基分辨率的m6A检测,无需抗体富集就能够针对性地对特定位点进行m6A修饰定量,样本间修饰丰度差异分析以及鉴定目标位点是否存在m6A修饰。我们与合作伙伴,致力于在全球范围内实施SELECT-m6A修饰定量检测技术成果转化的授权,为客户提供多款基于SELECT技术检测的试剂盒,填补市场上特定位点m6A常规检测技术的空白,协助研究者鉴定m6A相关蛋白的作用靶点,深入挖掘m6A修饰的作用机制,有望为RNA m6A修饰分子标志物的发现带来新突破。

    m6A修饰丰度差异检测试剂盒原理图

    m6A修饰丰度差异检测试剂盒基于SELECT技术,通过qPCR方法对A碱基进行修饰位点检测,并通过FTO去甲基化处理进一步鉴定的试剂盒。

    参数 MeRIP-qPCR SELECT
    精确度 需要 不需要
    能否单碱基定量 不可以 可以
    总RNA样本所需量 >20μg >1μg
    实验时长 >1天 >3小时
    实验费用 昂贵 便宜
    操作难度 简单
    应用 1.验证样本间特定位点m6A修饰丰度差异;2.鉴定m6A修饰相关蛋白的作用靶点 1.验证样本间特定位点m6A修饰丰度差异;2.检测RNA目标位点是否存在m6A修饰;3.对特定位点的m6A修饰丰度进行绝对定量;4.鉴定m6A修饰相关蛋白的作用靶点

    m6A修饰丰度差异检测试剂盒工作原理:基于单碱基延伸和连接后产物qPCR检测的方法。利用FTO去甲基酶,把RNA模板的mA修饰位点去掉,然后将设计在A位点两端的探针退火后,用高效的SELECT DNA聚合酶的延伸单碱基、SELECT连接酶的缺口连接,由于RNA模板中mA修饰抑制SELECT DNA聚合酶介导的单基延伸,少量延伸产物仍将从RNA模板中给定的A修饰位点形成。在后续的SELECT连接酶的缺口连接中,mA修饰抑制SELECT连接酶的连接活性,经过退火延伸连接后进行qPCR检测。


    对比FTO处理后ct值的差异,无m6A修饰位点的RNA模板形成的产物基本一致,即有无FTO处理的样本ct值基本一致,而有A修饰位点的RNA模板形成的产物变化较大,经FTO处理后Ct值明显变小,从而实现简单的基于qPCR的方法进行对m6A位点修饰检测及鉴定。

    图1.qPCR扩增曲线和CT值柱形图显示,HeLa细胞IncRNA MALAT1(e)以及HEK293T细胞mRNA H1F0(f)的m6A位点和非m6A位点[1]

    图2.利用系列浓度梯度的已知m6A成分标准品制作标准曲线,然后对特定位点上的m6A修饰成分进行定量[1]
    图3.SELECT:分析IncRNA MALAT1和以及METTL3+/-细胞(对照组)的m6A2515和A2511(input对照)位点,荧光扩增曲线和PCR CT值柱状图显示IncRNA MALAT.1的2515位点是METTL3的一个靶点[1]

    m6A修饰丰度差异检测试剂盒具有如下优势和特性:

    • 荧光定量PCR进行精确定量,达到单碱基分辨率
    • 无需抗体IP,无需同位素标记,降低成本,可操作性高
    • 灵敏度高,总RNA所需样本低至1μg

    m6A修饰丰度差异检测试剂盒应用领域:

    • 验证样本间特定位点m6A修饰丰度差异
    • 检测RNA目标位点是否存在m6A修饰
    • 对特定位点的m6A修饰丰度进行绝对定量
    • 鉴定m6A修饰相关蛋白的作用靶点
  • 产品组分

    组分内容 型号:R2023-01(100次) 型号:R2023-02(200次)

    储存温度

    SELECT DNA polymerase

    30 μL 60 μL -20℃
    SELECT ligase 50 μL 100 μL -20℃
    Up Probe (0.5μM)* / / -20℃
    Down Probe (0.5μM)* / / -20℃
    Gene specific primers (F)* / / -20℃
    Gene specific primers (R)* / / -20℃
    10X Reaction buffer 200 μL 400 μL -20℃
    dNTP 200 μL 400 μL -20℃
    ATP 250 μL 500 μL -20℃
    Select F (10μM) 100 μL 200 μL -20℃
    Select R (10μM) 100 μL 200 μL -20℃
    操作手册 1 1

    室温

    *注意:在将离心柱放入微型离心机之前,始终将离心柱盖子旋紧盖严。Up Probe,Down Probe需根据MeRIP-Seq分析得到peak区域,检测符合m6A motif修饰特征后,设计探针。Gene specific primer(F/R)设计,设计基因特异性引物并进行qPCR定量,以控制对照与实验组初始RNA量是一致的。

  • 文件资源

    文件下载

    文件内容

    资源说明

    R2023-m6A修饰丰度差异检测试剂盒

    操作手册

    R2023-m6A修饰丰度差异检测试剂盒相关产品

    宣传单页
  • 营销中心

  • 注意事项

    保存建议推荐蓝冰或冰袋运输。当您收到产品后,按照说明书建议保存各组分。
    警告本品仅供科研使用,请勿用于临床与诊断。

     

  • FAQ

     

  • [1]Xiao Y,Wang Y,Tang Q,et al.An Elongation-and Ligation-Based qPCR Amplification Method for the Radiolabeling-Free Detection of Locus-Specific N6-Methyladenosine Modification.Angew Chem Int Ed Engl.2018 Dec 3;57(49):15995-16000.
    [2]Yu L,Alariqi M,Li B,et al.CRISPR/dCas13(Rx)Derived RNA N6-methyladenosine(m6A)Dynamic Modification in Plant.Adv Sci(Weinh).2024;11(39):e2401118.doi:10.1002/advs.202401118(SELECT客户文章)
    [3]Yu H,Li QS,Guo JN,et al.METTL14-mediated m6A methylation of pri-miR-5099 to facilitate cardiomyocyte pyroptosis in myocardialinfarction.Acta Pharmacol Sin.Published online February 12,2025.doi:10.1038/s41401-025-01485-y (SELECT
    [4]Chen,H.,Zhao,X.,Yang,W.et al.RNA N6-methyladenosine modification-based biomarkers for absorbed ionizing radiation dose estimation.Nat Commun14,6912(2023).(SELECT客户文章)
    [5]Huang J,Jiang B,Li GW,et al.m6A-modified lincRNA Dubr is required for neuronal development by stabilizing YTHDF1/3 and facilitatingmRNA translation.Cell Rep.2022Nov22;41(8):111693.(SELECT客户文章)
    [6]Zhang S,Lv C,Niu Y,et al.RBM3 suppresses stemness remodeling of prostate cancer in bone microenvironment by modulating N6-methyladenosine on CTNNB1mRNA.Cell Death Dis.2023Feb7;14(2):91.(SELECT客户文章)
    [7]Tan L,Qin Y,Xie R,et al.N6-methyladenosine-associated prognostic pseudogenes contribute to predicting immunotherapy benefits andtherapeutic agents in head and neck squamous cell carcinoma.Theranostics 2022;12(17).(SELECT)
    [8]Chen X,Wang Y,Wang JN,et al.m6A modification of circSPECC1 suppresses RPE oxidative damage and maintains retinal homeostasis.CellRep.2022Nov15;41(7):111671.(SELECT客户文章)
    [9]Sheng R,Meng W,Zhang Z,et al.METTL3 regulates cartilage development and homeostasis by affecting Lats1 mRNA stability in an m6A-YTHDF2-dependent manner.Cell Rep.2024;43(8):114535.doi:10.1016/j.celrep.2024.114535 (SELECT
    [9]Sheng R,Meng W,Zhang Z,et al.METTL3 regulates cartilage development and homeostasis by affecting Lats1 mRNA stability in an m6A-YTHDF2-dependent manner.Cell Rep.2024;43(8):114535.doi:10.1016/j.celrep.2024.114535 (SELECT 客户文章)
    [10]Zhou J,Tang J,Zhang C,et al.ALKBH5 targets ACSL4 mRNA stability to modulate ferroptosis in hyperbilirubinemia-induced brain damage.Free Radic Biol Med.2024;220:271-287.doi:10.1016/j.freeradbiomed.2024.05.014 (SELECT客户文章)
    [11]Cai B,Ma M,Yuan R,et al.MYH1G-AS is a chromatin-associated IncRNA that regulates skeletal muscle development in chicken.Cell MolBiol Lett.2024Jan4;29(1):9.(SELECT客户文章)
    [12]Li L,Cheng H,Zhou Y,et al.METTL3 regulates autophagy of hypoxia-induced cardiomyocytes by targeting ATG7.Cell Death Discov.2025;11(1):37.Published2025Feb1.doi:10.1038/s41420-025-02320-3(SELECT客户文章)
    [13]Liu K,Wang X,Wang J,et al.N 6-methyladenosine modifications stabilize phosphate starvation response-related mRNAs in plantadaptation to nutrient-deficient stress.Nat Commun.2025;16(1):4093.Published 2025 May 1.doi:10.1038/s41467-025-59331-y (SELECT章)

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